行業(yè)動(dòng)態(tài)
G4s是由富含鳥(niǎo)嘌呤序列形成的獨(dú)特的DNA結(jié)構(gòu),在基因調(diào)控和基因組穩(wěn)定性方面發(fā)揮著越來(lái)越重要的作用。傳統(tǒng)上,對(duì)G4s的理解一直局限于體外研究。然而,最近的進(jìn)展使研究人員能夠探索它們?cè)谂囵B(yǎng)細(xì)胞中的全基因組分布。
令人驚訝的是,G4s存在于許多缺乏經(jīng)典G-重復(fù)序列的基因組區(qū)域,而這些區(qū)域之前被認(rèn)為是形成G4s所必需的。盡管識(shí)別了各種G4-結(jié)合蛋白,但確定人類(lèi)細(xì)胞中蛋白質(zhì)與G4s結(jié)合的程度仍然難以捉摸。
DOI: 10.18632/oncotarget.28564
以前研究G4s的方法,如G4-ChIP受到限制,導(dǎo)致對(duì)那些逃脫蛋白質(zhì)交聯(lián)的蛋白質(zhì)有偏見(jiàn)的表征。為了應(yīng)對(duì)這些挑戰(zhàn),研究人員提出了一種創(chuàng)新性的方案,用于從細(xì)胞中高效捕獲,這種方法克服了人工后固定formed-G4的檢測(cè),提供了更準(zhǔn)確的方法。
通過(guò)這項(xiàng)創(chuàng)新技術(shù)的應(yīng)用,研究人員揭示了G4s在特定的基因組區(qū)域(如SINEs)很少形成,并證明了某些蛋白質(zhì)的消耗如何增強(qiáng)G4在特定位點(diǎn)的捕獲,使得這項(xiàng)研究加深了我們對(duì)影響基因組形成的調(diào)控機(jī)制的理解。
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