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Nature子刊:超毒力性克雷伯氏肺炎菌的RNA相互作用組揭示抑制莢膜粘液性和毒力的小RNA
來源: | 作者:li | 發(fā)布時間: 302天前 | 439 次瀏覽 | 分享到:


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超毒力性克雷伯氏肺炎菌(HvKP)是一種新興的細(xì)菌病原體,能夠在免疫功能正常的人群中引發(fā)侵襲性感染。HvKP的高毒力與過度產(chǎn)生的高粘液性莢膜密切相關(guān),但這種高粘液性(HMV)的調(diào)控機(jī)制,特別是由小非編碼RNAsRNAs)介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機(jī)制,尚不清楚。小RNA在細(xì)菌的基因表達(dá)調(diào)控中扮演重要角色,尤其是在感染過程中,它們可以通過與目標(biāo)mRNA結(jié)合,影響蛋白質(zhì)的表達(dá),從而調(diào)節(jié)細(xì)菌的毒力和存活能力。因此,理解HvKP中的小RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)對于揭示其高毒力機(jī)制具有重要意義。

 

本研究使用了iRIL-seq,這是一種新開發(fā)的RNA相互作用組學(xué)(RNA interactome profiling)方法,用來探討HvKP中與Hfq蛋白相關(guān)的小RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。Hfq是一個廣泛存在于細(xì)菌中的RNA結(jié)合蛋白,通常與小RNA結(jié)合并調(diào)控基因表達(dá)。通過iRIL-seq,研究人員能夠繪制出HvKP內(nèi)部的RNA-RNA相互作用組,并識別與HMV相關(guān)的小RNA及其目標(biāo)mRNA。隨后,他們對發(fā)現(xiàn)的關(guān)鍵小RNA及其調(diào)控基因進(jìn)行了功能驗(yàn)證,包括體外和體內(nèi)的實(shí)驗(yàn),以確定其對細(xì)菌毒力和HMV的影響。

1. RNA-RNA相互作用組的構(gòu)建:研究揭示了HvKP中大量的小RNAHMV相關(guān)mRNA的相互作用網(wǎng)絡(luò),確定了多個調(diào)節(jié)HMV的小RNA,這些小RNA能夠抑制或促進(jìn)HMV。

 

2. ArcZRNA的發(fā)現(xiàn):其中,ArcZ被確定為最強(qiáng)的HMV抑制因子之一。ArcZ由代謝調(diào)節(jié)蛋白CRP激活,能夠靶向調(diào)控多個HMV相關(guān)基因,包括mlaAfbp。

 

3. MlaA的功能及其在HMV中的作用:研究發(fā)現(xiàn)MlaA蛋白在磷脂運(yùn)輸中發(fā)揮重要作用,對莢膜保持和HMV至關(guān)重要。MlaA失活可導(dǎo)致HvKP毒力在小鼠體內(nèi)的完全喪失。

 

4. ArcZ的治療潛力:過表達(dá)ArcZ可顯著減少小鼠體內(nèi)的細(xì)菌負(fù)荷,并降低多株超毒力性和碳青霉烯耐藥性臨床分離株的HMV。這表明ArcZ可能是一種具有治療潛力的RNA抑制劑,可用于治療細(xì)菌性肺炎。


本研究揭示了一個新的CRP-ArcZ-MlaA調(diào)控回路,這一發(fā)現(xiàn)為理解超毒力性克雷伯氏肺炎菌的轉(zhuǎn)錄后毒力調(diào)控機(jī)制提供了重要線索。同時,這一研究也指出了ArcZ作為潛在治療靶點(diǎn)的可能性,尤其是在抗生素耐藥性日益嚴(yán)重的背景下,針對RNA調(diào)控途徑的治療策略可能為開發(fā)新型抗菌療法提供新的方向。

 

未來的研究可以進(jìn)一步探討:

1. 其他小RNA的功能:雖然本文重點(diǎn)研究了ArcZ,但HvKP中還有許多與HMV相關(guān)的小RNA,它們的具體作用和調(diào)控機(jī)制仍需進(jìn)一步研究。

2. 臨床應(yīng)用:將ArcZ或其類似物應(yīng)用于臨床治療的可行性,特別是在多藥耐藥菌株的背景下,可能會帶來突破性的進(jìn)展。

3. RNA干擾療法的發(fā)展:隨著對RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的理解不斷深入,未來可能開發(fā)出更為精準(zhǔn)和有效的RNA干擾療法,用于治療由超毒力性病原體引發(fā)的感染。


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