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RNA分子的不同區(qū)域通?？梢耘c不同的RNA結(jié)合蛋白(rbp)進(jìn)行特定的相互作用，從而產(chǎn)生不同的RNA調(diào)節(jié)和功能模式。然而，目前還沒有方法可以公正地鑒定活細(xì)胞和內(nèi)源性環(huán)境下與特定RNA區(qū)域相互作用的rbp。研究人員揭示了一種稱為TREX(靶向RNA-蛋白質(zhì)交換)的開創(chuàng)性方法，該方法可以識(shí)別活細(xì)胞內(nèi)與特定RNA區(qū)域結(jié)合的蛋白質(zhì)。這項(xiàng)名為“TREX reveals proteins that bind to specific RNA regions in living cells”的研究代表了在理解RNA-蛋白質(zhì)相互作用方面的重大進(jìn)步，并有望在生物學(xué)和醫(yī)學(xué)中的各種應(yīng)用中得到應(yīng)用。

圖源：Nature Methods ：TREX reveals proteins that bind to specific RNA regions in living cells

RNA-蛋白相互作用在許多細(xì)胞過程中起著至關(guān)重要的作用，包括基因表達(dá)、RNA加工和調(diào)控。然而，在活細(xì)胞中研究這些相互作用提出了重大挑戰(zhàn)。TREX方法通過識(shí)別活細(xì)胞復(fù)雜環(huán)境中與特定RNA區(qū)域相互作用的蛋白質(zhì)，克服了這些障礙。

研究將TREX作為一種強(qiáng)大的工具，用于解開活細(xì)胞中RNA-蛋白質(zhì)相互作用的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)，通過提供一種識(shí)別與特定RNA區(qū)域結(jié)合的蛋白質(zhì)的方法，TREX為理解基本生物過程和開發(fā)新的治療策略開辟了新的途徑。TREX方法結(jié)合了RNA標(biāo)記、蛋白質(zhì)交聯(lián)、免疫沉淀和質(zhì)譜分析等創(chuàng)新技術(shù)。這種綜合方法使研究人員能夠以前所未有的精度和靈敏度確定與靶RNA區(qū)域相關(guān)的蛋白質(zhì)。

利用TREX，研究小組成功地識(shí)別了活細(xì)胞內(nèi)與特定RNA區(qū)域結(jié)合的多種蛋白質(zhì)，這些發(fā)現(xiàn)揭示了RNA-蛋白相互作用的復(fù)雜性及其在細(xì)胞功能中的作用，為后續(xù)的研究奠定了基礎(chǔ)。

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