行業(yè)動態(tài)
在我們細(xì)胞內(nèi)基因表達(dá)的復(fù)雜體系中,信使RNA (mRNA)的命運微妙地懸在它尾巴的長度上。這條尾巴由腺嘌呤核苷酸以poly(A)序列組成,在決定mRNA分子的穩(wěn)定性和翻譯效率方面起著至關(guān)重要的作用。但是,當(dāng)這條尾巴遭受無情的退化力量時,會發(fā)生什么呢?它是如何在一個被稱為死基化的過程中,一個核苷酸一個核苷酸地解開的?
為了揭開這種細(xì)胞編排的奧秘,科學(xué)家們深入研究了遺傳調(diào)控的復(fù)雜世界,以前所未有的精度揭示了mRNA衰變的隱藏動力學(xué)。研究出單核苷酸分辨率下混合多poly (A)尾部的死基化動力學(xué)——這一壯舉將徹底改變我們對分子水平上細(xì)胞過程的理解。
圖源:Nature(2024),DOI: 10.1038/s41594-023-01187-1
想象一下,在一個充滿活力的實驗室里,mRNA分子被仔細(xì)地從細(xì)胞環(huán)境中分離出來并被標(biāo)記,它們的poly (A)尾部被熒光標(biāo)記物或生物素分子標(biāo)記。然后,這些被標(biāo)記的分子受到精心安排的時間過程實驗的影響,降解的倒計時開始了。隨著時間的流逝,每隔一段時間采集一次樣品,在deadenylation的不同階段冷凍這個過程。這些快照捕捉了poly (A)尾部在不同狀態(tài)下的分解,揭示了分子衰變的復(fù)雜性。但科學(xué)家們是如何解讀這種分子“交響樂”的呢? 高通量測序是一種強大的技術(shù),可以非常精確地讀取遺傳密碼。有了測序數(shù)據(jù)在手,研究人員潛入核苷酸的海洋,用單核苷酸分辨率解析poly (A)尾的長度。
每一個被讀取的序列都成為這個謎題的一部分,讓我們得以一窺單個mRNA分子的命運。然后,統(tǒng)計分析和數(shù)學(xué)模型將這些信息片段編織成一個連貫的敘述,揭示死基化的動力學(xué),并闡明驅(qū)動mRNA衰變的潛在機制。
但這段旅程并沒有以數(shù)據(jù)分析結(jié)束。進(jìn)行了驗證實驗,進(jìn)一步探討了影響deadenylation動力學(xué)的因素。RNA結(jié)合蛋白、調(diào)控元件和細(xì)胞信號通路之間錯綜復(fù)雜的相互作用都受到了仔細(xì)的研究,為基因調(diào)控的動態(tài)世界描繪了一幅更豐富的圖景。
在科學(xué)界慶祝這一突破性成就的同時,mRNA衰變的分子之舞之旅仍在繼續(xù)。隨著每一項重大的發(fā)現(xiàn),離揭開人類基因組的奧秘又近了一步。
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